Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms