Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb2Q00977 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms