Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms