Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SeleQ00690 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SeleQ00690 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms