Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms