Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmsP97355 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmsP97355 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmsP97355 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms