Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irx1P81068 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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