Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ptprn2P80560 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms