Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux2P70298 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux2P70298 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms