Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfixP70257 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfixP70257 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfixP70257 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NfixP70257 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfixP70257 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NfixP70257 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NfixP70257 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NfixP70257 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms