Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf5P70191 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Traf5P70191 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms