Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl23P62830 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms