Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab3cP62823 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab3cP62823 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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