Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snap25P60879 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms