Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl3P58873 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms