Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp20P57748 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms