Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms