Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TdgP56581 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TdgP56581 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TdgP56581 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TdgP56581 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TdgP56581 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms