Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp5P56399 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp5P56399 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms