Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NcanP55066 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NcanP55066 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NcanP55066 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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