Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
FmodP50608 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FmodP50608 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms