Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LtbrP50284 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms