Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms