Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfbP49766 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms