Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbp3P49194 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms