Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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