Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl13P47963 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl13P47963 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms