Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sept1P42209 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms