Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig1P37913 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms