Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprkP35822 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms