Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin1P35438 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms