Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp4P35123 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp4P35123 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp4P35123 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp4P35123 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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