Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ifnar1P33896 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms