Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VtnP29788 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VtnP29788 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms