Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NapbP28663 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NapbP28663 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NapbP28663 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NapbP28663 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms