Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa5P28312 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa5P28312 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms