Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb1P28230 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb1P28230 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms