Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CftrP26361 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CftrP26361 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CftrP26361 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CftrP26361 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CftrP26361 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CftrP26361 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CftrP26361 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CftrP26361 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms