Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Xrcc6P23475 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrcc6P23475 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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