Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PrkchP23298 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms