Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pou3f1P21952 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pou3f1P21952 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pou3f1P21952 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pou3f1P21952 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms