Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnnc2P20801 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnnc2P20801 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms