Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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