Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fcer1aP20489 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms