Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms