Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TP20293 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TP20293 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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TP20293 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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TP20293 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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TP20293 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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TP20293 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TP20293 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TP20293 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms