Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pou5f1P20263 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms