Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cox5bP19536 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cox5bP19536 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms