Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PcnaP17918 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms