Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Spi1P17433 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Spi1P17433 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms